Rakovina pankreasu je jedným z najsmrteľnejších nádorov na svete so zlou prognózou. Preto je potrebný presný predikčný model na identifikáciu pacientov s vysokým rizikom rakoviny pankreasu, aby sa prispôsobila liečba a zlepšila prognóza týchto pacientov.
Získali sme údaje RNAseq pankreatického adenokarcinómu (PAAD) z atlasu Cancer Genome Atlas (TCGA) z databázy UCSC Xena, identifikovali sme imunitne súvisiace lncRNA (irlncRNA) pomocou korelačnej analýzy a identifikovali sme rozdiely medzi tkanivami TCGA a normálnymi tkanivami pankreatického adenokarcinómu. DEirlncRNA) z TCGA a expresia genotypového tkaniva (GTEx) pankreatického tkaniva. Na vytvorenie prognostických podpisových modelov boli vykonané ďalšie univariačné a laso regresné analýzy. Následne sme vypočítali plochu pod krivkou a určili optimálnu medznú hodnotu na identifikáciu pacientov s vysokorizikovým a nízkorizikovým adenokarcinómom pankreasu. Porovnali sme klinické charakteristiky, infiltráciu imunitných buniek, imunosupresívne mikroprostredie a rezistenciu na chemoterapiu u pacientov s vysokorizikovým a nízkorizikovým karcinómom pankreasu.
Identifikovali sme 20 párov DEirlncRNA a pacientov sme zoskupili podľa optimálnej hraničnej hodnoty. Preukázali sme, že náš prognostický podpisový model má významný výkon pri predpovedaní prognózy pacientov s PAAD. AUC ROC krivky je 0,905 pre 1-ročnú prognózu, 0,942 pre 2-ročnú prognózu a 0,966 pre 3-ročnú prognózu. Pacienti s vysokým rizikom mali nižšiu mieru prežitia a horšie klinické charakteristiky. Taktiež sme preukázali, že pacienti s vysokým rizikom sú imunosuprimovaní a môžu si vyvinúť rezistenciu na imunoterapiu. Hodnotenie protirakovinových liekov, ako je paklitaxel, sorafenib a erlotinib, na základe výpočtových predikčných nástrojov môže byť vhodné pre pacientov s vysokým rizikom s PAAD.
Celkovo naša štúdia vytvorila nový prognostický model rizika založený na párovej irlncRNA, ktorý preukázal sľubnú prognostickú hodnotu u pacientov s rakovinou pankreasu. Náš prognostický model rizika môže pomôcť rozlíšiť pacientov s PAAD, ktorí sú vhodní na medikamentóznu liečbu.
Rakovina pankreasu je malígny nádor s nízkou päťročnou mierou prežitia a vysokým stupňom. V čase diagnózy je väčšina pacientov už v pokročilom štádiu. V kontexte epidémie COVID-19 sú lekári a zdravotné sestry pod obrovským tlakom pri liečbe pacientov s rakovinou pankreasu a rodiny pacientov čelia tiež viacerým tlakom pri rozhodovaní o liečbe [1, 2]. Hoci sa v liečbe DOAD dosiahol veľký pokrok, ako je neoadjuvantná terapia, chirurgická resekcia, rádioterapia, chemoterapia, cielená molekulárna terapia a inhibítory imunitných kontrolných bodov (ICI), iba približne 9 % pacientov prežije päť rokov po diagnóze [3]. ], 4]. Keďže skoré príznaky adenokarcinómu pankreasu sú atypické, pacientom sú metastázy zvyčajne diagnostikované v pokročilom štádiu [5]. Preto musí individualizovaná komplexná liečba pre daného pacienta zvážiť výhody a nevýhody všetkých možností liečby, nielen na predĺženie prežitia, ale aj na zlepšenie kvality života [6]. Preto je na presné posúdenie prognózy pacienta potrebný účinný predikčný model [7]. Takto je možné zvoliť vhodnú liečbu, ktorá vyváži prežitie a kvalitu života pacientov s PAAD.
Zlá prognóza PAAD je spôsobená najmä rezistenciou na chemoterapiu. V posledných rokoch sa inhibítory imunitných kontrolných bodov široko používajú pri liečbe solídnych nádorov [8]. Použitie ICI pri rakovine pankreasu je však zriedkavo úspešné [9]. Preto je dôležité identifikovať pacientov, ktorí by mohli mať z liečby ICI úžitok.
Dlhá nekódujúca RNA (lncRNA) je typ nekódujúcej RNA s transkriptmi > 200 nukleotidov. LncRNA sú rozšírené a tvoria približne 80 % ľudského transkriptómu [10]. Rozsiahle množstvo prác ukázalo, že prognostické modely založené na lncRNA dokážu účinne predpovedať prognózu pacienta [11, 12]. Napríklad bolo identifikovaných 18 lncRNA súvisiacich s autofágiou, ktoré generujú prognostické podpisy pri rakovine prsníka [13]. Šesť ďalších lncRNA súvisiacich s imunitou bolo použitých na stanovenie prognostických znakov gliómu [14].
V prípade rakoviny pankreasu niektoré štúdie preukázali, že podpisy založené na lncRNA môžu predpovedať prognózu pacienta. Podpis 3-lncRNA bol preukázaný v adenokarcinóme pankreasu s plochou pod ROC krivkou (AUC) iba 0,742 a celkovým prežitím (OS) 3 roky [15]. Okrem toho sa hodnoty expresie lncRNA líšia medzi rôznymi genómami, rôznymi formátmi údajov a rôznymi pacientmi a výkon prediktívneho modelu je nestabilný. Preto používame nový modelovací algoritmus, párovanie a iteráciu, na generovanie podpisov lncRNA súvisiacich s imunitou (irlncRNA) s cieľom vytvoriť presnejší a stabilnejší predikčný model [8].
Normalizované údaje RNAseq (FPKM) a údaje o klinickej expresii TCGA a tkaniva genotypu (GTEx) pri rakovine pankreasu boli získané z databázy UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/). Súbory GTF boli získané z databázy Ensembl (http://asia.ensembl.org) a použité na extrakciu profilov expresie lncRNA z RNAseq. Gény súvisiace s imunitou sme stiahli z databázy ImmPort (http://www.immport.org) a identifikovali sme lncRNA súvisiace s imunitou (irlncRNA) pomocou korelačnej analýzy (p < 0,001, r > 0,4). Identifikácia diferencovane exprimovaných irlncRNA (DEirlncRNA) krížením irlncRNA a diferencovane exprimovaných lncRNA získaných z databázy GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) v kohorte TCGA-PAAD (|logFC| > 1 a FDR < 0,05).
Táto metóda bola už skôr publikovaná [8]. Konkrétne konštruujeme X, aby sme nahradili párové lncRNA A a lncRNA B. Keď je hodnota expresie lncRNA A vyššia ako hodnota expresie lncRNA B, X je definované ako 1, inak je X definované ako 0. Preto môžeme získať maticu 0 alebo –1. Vertikálna os matice predstavuje každú vzorku a horizontálna os predstavuje každý pár DEirlncRNA s hodnotou 0 alebo 1.
Na skríning prognostických párov DEirlncRNA bola použitá univariačná regresná analýza, po ktorej nasledovala lasso regresia. Laso regresná analýza použila 10-násobnú krížovú validáciu opakovanú 1000-krát (p < 0,05) s 1000 náhodnými stimulmi na beh. Keď frekvencia každého páru DEirlncRNA prekročila 100-krát v 1000 cykloch, páry DEirlncRNA boli vybrané na vytvorenie prognostického modelu rizika. Následne sme použili krivku AUC na nájdenie optimálnej medznej hodnoty pre klasifikáciu pacientov s PAAD do skupín s vysokým a nízkym rizikom. Hodnota AUC každého modelu bola tiež vypočítaná a znázornená ako krivka. Ak krivka dosiahne najvyšší bod označujúci maximálnu hodnotu AUC, proces výpočtu sa zastaví a model sa považuje za najlepšieho kandidáta. Boli vytvorené 1-, 3- a 5-ročné modely ROC krivky. Na preskúmanie nezávislej prediktívnej výkonnosti prognostického modelu rizika boli použité univariačné a multivariačné regresné analýzy.
Na štúdium miery infiltrácie imunitných buniek sme použili sedem nástrojov vrátane XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS a CIBERSORT. Údaje o infiltrácii imunitných buniek boli stiahnuté z databázy TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Rozdiel v obsahu imunitne infiltrujúcich buniek medzi skupinami s vysokým a nízkym rizikom v zostavenom modeli bol analyzovaný pomocou Wilcoxonovho testu znamienkových radov, výsledky sú zobrazené v štvorcovom grafe. Na analýzu vzťahu medzi hodnotami skóre rizika a imunitne infiltrujúcimi bunkami bola vykonaná Spearmanova korelačná analýza. Výsledný korelačný koeficient je zobrazený ako lízanka. Prah významnosti bol stanovený na p < 0,05. Postup bol vykonaný pomocou balíka R ggplot2. Na preskúmanie vzťahu medzi modelom a úrovňami génovej expresie spojenými s mierou infiltrácie imunitných buniek sme vykonali balík ggstatsplot a vizualizáciu pomocou Violin Plot.
Na vyhodnotenie klinických liečebných postupov pri rakovine pankreasu sme vypočítali IC50 bežne používaných chemoterapeutických liekov v kohorte TCGA-PAAD. Rozdiely v polovičných inhibičných koncentráciách (IC50) medzi skupinami s vysokým a nízkym rizikom boli porovnané pomocou Wilcoxonovho testu znamienkových radov a výsledky sú zobrazené ako boxploty vygenerované pomocou pRRophetic a ggplot2 v R. Všetky metódy sú v súlade s príslušnými smernicami a normami.
Pracovný postup našej štúdie je znázornený na obrázku 1. Pomocou korelačnej analýzy medzi lncRNA a génmi súvisiacimi s imunitou sme vybrali 724 irlncRNA s p < 0,01 a r > 0,4. Ďalej sme analyzovali diferencovane exprimované lncRNA GEPIA2 (obrázok 2A). Celkovo bolo medzi pankreatickým adenokarcinómom a normálnym pankreatickým tkanivom diferencovane exprimovaných 223 irlncRNA (|logFC| > 1, FDR < 0,05), pomenovaných DEirlncRNA.
Konštrukcia prediktívnych modelov rizika. (A) Sopkový graf diferencovane exprimovaných lncRNA. (B) Rozdelenie laso koeficientov pre 20 párov DEirlncRNA. (C) Čiastočná variancia pravdepodobnosti rozdelenia LASSO koeficientov. (D) Forestov graf znázorňujúci univariačnú regresnú analýzu 20 párov DEirlncRNA.
Následne sme zostrojili maticu 0 alebo 1 párovaním 223 DEirlncRNA. Celkovo bolo identifikovaných 13 687 párov DEirlncRNA. Po univariačnej a laso regresnej analýze bolo nakoniec testovaných 20 párov DEirlncRNA na vytvorenie prognostického modelu rizika (obrázok 2B-D). Na základe výsledkov laso a viacnásobnej regresnej analýzy sme vypočítali skóre rizika pre každého pacienta v kohorte TCGA-PAAD (tabuľka 1). Na základe výsledkov laso regresnej analýzy sme vypočítali skóre rizika pre každého pacienta v kohorte TCGA-PAAD. AUC ROC krivky bola 0,905 pre 1-ročnú predikciu modelu rizika, 0,942 pre 2-ročnú predikciu a 0,966 pre 3-ročnú predikciu (obrázok 3A-B). Optimálnu hraničnú hodnotu sme stanovili na 3,105, stratifikovali sme pacientov z kohorty TCGA-PAAD do skupín s vysokým a nízkym rizikom a znázornili sme výsledky prežitia a rozdelenie skóre rizika pre každého pacienta (obrázok 3C-E). Kaplanova-Meierova analýza ukázala, že prežitie pacientov s PAAD vo vysoko rizikovej skupine bolo významne nižšie ako u pacientov v nízko rizikovej skupine (p < 0,001) (obrázok 3F).
Platnosť prognostických modelov rizika. (A) ROC krivka prognostického modelu rizika. (B) 1-, 2- a 3-ročné prognostické modely rizika ROC. (C) ROC krivka prognostického modelu rizika. Zobrazuje optimálny hraničný bod. (DE) Rozdelenie stavu prežitia (D) a skóre rizika (E). (F) Kaplanova-Meierova analýza pacientov s PAAD vo vysokorizikových a nízkorizikových skupinách.
Ďalej sme hodnotili rozdiely v skóre rizika podľa klinických charakteristík. Pruhový graf (obrázok 4A) zobrazuje celkový vzťah medzi klinickými charakteristikami a skóre rizika. Najmä starší pacienti mali vyššie skóre rizika (obrázok 4B). Okrem toho pacienti so štádiom II mali vyššie skóre rizika ako pacienti so štádiom I (obrázok 4C). Pokiaľ ide o stupeň nádoru u pacientov s PAAD, pacienti so stupňom 3 mali vyššie skóre rizika ako pacienti s stupňom 1 a 2 (obrázok 4D). Ďalej sme vykonali univariačné a multivariačné regresné analýzy a preukázali sme, že skóre rizika (p < 0,001) a vek (p = 0,045) boli nezávislými prognostickými faktormi u pacientov s PAAD (obrázok 5A-B). ROC krivka preukázala, že skóre rizika bolo lepšie ako iné klinické charakteristiky pri predpovedaní 1-, 2- a 3-ročného prežitia pacientov s PAAD (obrázok 5C-E).
Klinické charakteristiky prognostických rizikových modelov. Histogram (A) zobrazuje (B) vek, (C) štádium nádoru, (D) stupeň nádoru, skóre rizika a pohlavie pacientov v kohorte TCGA-PAAD. **p < 0,01
Nezávislá prediktívna analýza prognostických rizikových modelov. (AB) Univariačné (A) a multivariačné (B) regresné analýzy prognostických rizikových modelov a klinických charakteristík. (CE) 1-, 2- a 3-ročný ROC test pre prognostické rizikové modely a klinické charakteristiky.
Preto sme skúmali vzťah medzi časom a skóre rizika. Zistili sme, že skóre rizika u pacientov s PAAD bolo nepriamo úmerné s CD8+ T bunkami a NK bunkami (obrázok 6A), čo naznačuje potlačenú imunitnú funkciu vo vysokorizikovej skupine. Taktiež sme hodnotili rozdiel v infiltrácii imunitných buniek medzi vysokorizikovou a nízkorizikovou skupinou a zistili sme rovnaké výsledky (obrázok 7). Vo vysokorizikovej skupine bola menšia infiltrácia CD8+ T buniek a NK buniek. V posledných rokoch sa inhibítory imunitných kontrolných bodov (ICI) široko používajú pri liečbe solídnych nádorov. Použitie ICI pri rakovine pankreasu však bolo zriedkavo úspešné. Preto sme hodnotili expresiu génov imunitných kontrolných bodov vo vysokorizikových a nízkorizikových skupinách. Zistili sme, že CTLA-4 a CD161 (KLRB1) boli v nízkorizikovej skupine nadmerne exprimované (obrázok 6B-G), čo naznačuje, že pacienti s PAAD v nízkorizikovej skupine môžu byť citliví na ICI.
Korelačná analýza modelu prognostického rizika a infiltrácie imunitných buniek. (A) Korelácia medzi modelom prognostického rizika a infiltráciou imunitných buniek. (BG) Označuje génovú expresiu vo vysokorizikových a nízkorizikových skupinách. (HK) Hodnoty IC50 pre špecifické protirakovinové lieky vo vysokorizikových a nízkorizikových skupinách. *p < 0,05, **p < 0,01, ns = nevýznamné
Ďalej sme hodnotili súvislosť medzi skóre rizika a bežnými chemoterapeutickými látkami v kohorte TCGA-PAAD. Hľadali sme bežne používané protirakovinové lieky pri rakovine pankreasu a analyzovali sme rozdiely v ich hodnotách IC50 medzi skupinami s vysokým a nízkym rizikom. Výsledky ukázali, že hodnota IC50 AZD.2281 (olaparib) bola vyššia vo vysoko rizikovej skupine, čo naznačuje, že pacienti s PAAD vo vysoko rizikovej skupine môžu byť rezistentní na liečbu AZD.2281 (obrázok 6H). Okrem toho boli hodnoty IC50 paklitaxelu, sorafenibu a erlotinibu nižšie vo vysoko rizikovej skupine (obrázok 6I-K). Ďalej sme identifikovali 34 protirakovinových liekov s vyššími hodnotami IC50 vo vysoko rizikovej skupine a 34 protirakovinových liekov s nižšími hodnotami IC50 vo vysoko rizikovej skupine (tabuľka 2).
Nemožno poprieť, že lncRNA, mRNA a miRNA sú široko prítomné a hrajú kľúčovú úlohu vo vývoji rakoviny. Existuje dostatok dôkazov podporujúcich dôležitú úlohu mRNA alebo miRNA pri predpovedaní celkového prežitia u niekoľkých typov rakoviny. Nepochybne je mnoho prognostických modelov rizika tiež založených na lncRNA. Napríklad štúdie Luo a kol. ukázali, že LINC01094 hrá kľúčovú úlohu v proliferácii a metastázovaní PC a vysoká expresia LINC01094 naznačuje nízke prežitie pacientov s rakovinou pankreasu [16]. Štúdia prezentovaná Linom a kol. ukázala, že downregulácia lncRNA FLVCR1-AS1 je spojená so zlou prognózou u pacientov s rakovinou pankreasu [17]. Avšak lncRNA súvisiace s imunitou sú relatívne menej diskutované z hľadiska predpovedania celkového prežitia pacientov s rakovinou. V poslednej dobe sa veľké množstvo práce zameralo na budovanie prognostických modelov rizika na predpovedanie prežitia pacientov s rakovinou a tým na úpravu liečebných metód [18, 19, 20]. Rastie uznanie dôležitej úlohy imunitných infiltrátov pri vzniku, progresii a reakcii na liečbu, ako je chemoterapia, ako je chemoterapia. Početné štúdie potvrdili, že nádorom infiltrujúce imunitné bunky hrajú kľúčovú úlohu v odpovedi na cytotoxickú chemoterapiu [21, 22, 23]. Imunitné mikroprostredie nádoru je dôležitým faktorom prežitia pacientov s nádorom [24, 25]. Imunoterapia, najmä ICI terapia, sa široko používa pri liečbe solídnych nádorov [26]. Gény súvisiace s imunitou sa široko používajú na konštrukciu prognostických modelov rizika. Napríklad Su a kol. Model prognostického rizika súvisiaceho s imunitou je založený na génoch kódujúcich proteíny na predpovedanie prognózy pacientov s rakovinou vaječníkov [27]. Nekódujúce gény, ako sú lncRNA, sú tiež vhodné na konštrukciu prognostických modelov rizika [28, 29, 30]. Luo a kol. testovali štyri imunitne súvisiace lncRNA a vytvorili prediktívny model pre riziko rakoviny krčka maternice [31]. Khan a kol. Celkovo bolo identifikovaných 32 diferencovane exprimovaných transkriptov a na základe toho bol vytvorený predikčný model s 5 významnými transkriptmi, ktorý bol navrhnutý ako vysoko odporúčaný nástroj na predpovedanie akútnej rejekcie po transplantácii obličky potvrdenej biopsiou [32].
Väčšina týchto modelov je založená na úrovniach génovej expresie, či už ide o gény kódujúce proteíny alebo nekódujúce gény. Ten istý gén však môže mať rôzne hodnoty expresie v rôznych genómoch, formátoch údajov a u rôznych pacientov, čo vedie k nestabilným odhadom v prediktívnych modeloch. V tejto štúdii sme vytvorili rozumný model s dvoma pármi dlhých nenukleotidových RNA (lncRNA), nezávislý od presných hodnôt expresie.
V tejto štúdii sme prvýkrát identifikovali irlncRNA prostredníctvom korelačnej analýzy s génmi súvisiacimi s imunitou. Skrínovali sme 223 DEirlncRNA hybridizáciou s diferencovane exprimovanými lncRNA. Potom sme zostavili maticu 0 alebo 1 na základe publikovanej metódy párovania DEirlncRNA [31]. Následne sme vykonali univariačné a laso regresné analýzy na identifikáciu prognostických párov DEirlncRNA a zostavenie prediktívneho modelu rizika. Ďalej sme analyzovali súvislosť medzi skóre rizika a klinickými charakteristikami u pacientov s PAAD. Zistili sme, že náš prognostický model rizika ako nezávislý prognostický faktor u pacientov s PAAD dokáže účinne rozlíšiť pacientov s vysokým stupňom od pacientov s nízkym stupňom a pacientov s vysokým stupňom od pacientov s nízkym stupňom. Okrem toho boli hodnoty AUC ROC krivky prognostického modelu rizika 0,905 pre 1-ročnú prognózu, 0,942 pre 2-ročnú prognózu a 0,966 pre 3-ročnú prognózu.
Výskumníci uviedli, že pacienti s vyššou infiltráciou CD8+ T buniek boli citlivejší na liečbu ICI [33]. Zvýšenie obsahu cytotoxických buniek, CD56 NK buniek, NK buniek a CD8+ T buniek v imunitnom mikroprostredí nádoru môže byť jedným z dôvodov supresívneho účinku nádoru [34]. Predchádzajúce štúdie ukázali, že vyššie hladiny nádor infiltrujúcich CD4(+) T a CD8(+) T boli významne spojené s dlhším prežitím [35]. Slabá infiltrácia CD8 T buniek, nízka neoantigénová záťaž a vysoko imunosupresívne mikroprostredie nádoru vedú k nedostatočnej odpovedi na terapiu ICI [36]. Zistili sme, že skóre rizika negatívne korelovalo s CD8+ T bunkami a NK bunkami, čo naznačuje, že pacienti s vysokým skóre rizika nemusia byť vhodní na liečbu ICI a majú horšiu prognózu.
CD161 je marker prirodzených zabíjačských (NK) buniek. CD8+CD161+ CAR-transdukované T bunky sprostredkovávajú zvýšenú protinádorovú účinnosť in vivo v xenotransplantátových modeloch HER2+ pankreatického duktálneho adenokarcinómu [37]. Inhibítory imunitných kontrolných bodov sa zameriavajú na dráhy cytotoxického proteínu 4 asociovaného s T lymfocytmi (CTLA-4) a proteínu programovanej bunkovej smrti 1 (PD-1)/ligandu programovanej bunkovej smrti 1 (PD-L1) a majú veľký potenciál v mnohých oblastiach. Expresia CTLA-4 a CD161 (KLRB1) je nižšia vo vysoko rizikových skupinách, čo ďalej naznačuje, že pacienti s vysokým rizikovým skóre nemusia byť spôsobilí na liečbu ICI. [38]
Aby sme našli možnosti liečby vhodné pre pacientov s vysokým rizikom, analyzovali sme rôzne protirakovinové lieky a zistili sme, že paklitaxel, sorafenib a erlotinib, ktoré sa široko používajú u pacientov s PAAD, môžu byť vhodné aj pre pacientov s vysokým rizikom s PAAD. [33]. Zhang a kol. zistili, že mutácie v akejkoľvek dráhe reakcie na poškodenie DNA (DDR) môžu viesť k zlej prognóze u pacientov s rakovinou prostaty [39]. Štúdia Pancreatic Cancer Olaparib Ongoing (POLO) ukázala, že udržiavacia liečba olaparibom predĺžila prežívanie bez progresie v porovnaní s placebom po chemoterapii na báze platiny prvej línie u pacientov s adenokarcinómom pankreatického duktu a mutáciami germinálnej línie BRCA1/2 [40]. To poskytuje významný optimizmus, že výsledky liečby sa v tejto podskupine pacientov významne zlepšia. V tejto štúdii bola hodnota IC50 AZD.2281 (olaparib) vyššia vo vysoko rizikovej skupine, čo naznačuje, že pacienti s PAAD vo vysoko rizikovej skupine môžu byť rezistentní na liečbu AZD.2281.
Predikčné modely v tejto štúdii poskytujú dobré predikčné výsledky, ale sú založené na analytických prognózach. Dôležitou otázkou je, ako tieto výsledky potvrdiť klinickými údajmi. Endoskopická ultrasonografia s tenkou ihlou (EUS-FNA) sa stala nevyhnutnou metódou na diagnostiku solídnych a extrapankreatických lézií pankreasu s citlivosťou 85 % a špecificitou 98 % [41]. Príchod ihiel s tenkou ihlou na biopsiu pankreasu (EUS-FNB) je založený najmä na vnímaných výhodách oproti FNA, ako je vyššia diagnostická presnosť, získanie vzoriek, ktoré zachovávajú histologickú štruktúru, a tým vytváranie imunitného tkaniva, ktoré je kritické pre určité diagnózy so špeciálnym farbením [42]. Systematický prehľad literatúry potvrdil, že ihly FNB (najmä 22G) vykazujú najvyššiu účinnosť pri odbere tkaniva z pankreatických hmôt [43]. Klinicky je len malý počet pacientov vhodných na radikálnu operáciu a väčšina pacientov má v čase počiatočnej diagnózy neoperovateľné nádory. V klinickej praxi je len malá časť pacientov vhodná na radikálnu operáciu, pretože väčšina pacientov má v čase počiatočnej diagnózy neoperovateľné nádory. Po patologickom potvrdení pomocou EUS-FNB a iných metód sa zvyčajne volí štandardizovaná nechirurgická liečba, ako je chemoterapia. Naším ďalším výskumným programom je otestovať prognostický model tejto štúdie v chirurgických a nechirurgických kohortách prostredníctvom retrospektívnej analýzy.
Celkovo naša štúdia vytvorila nový prognostický model rizika založený na párovej irlncRNA, ktorý preukázal sľubnú prognostickú hodnotu u pacientov s rakovinou pankreasu. Náš prognostický model rizika môže pomôcť rozlíšiť pacientov s PAAD, ktorí sú vhodní na medikamentóznu liečbu.
Súbory údajov použité a analyzované v tejto štúdii sú k dispozícii od príslušného autora na základe primeranej žiadosti.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Sprostredkujúca úloha sebaúčinnosti v emocionálnej regulácii negatívnych emócií počas pandémie COVID-19: prierezová štúdia. Int J Ment Health Nurs [článok v časopise]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J a kol. Názory rodinných príslušníkov na alternatívne rozhodovanie na jednotkách intenzívnej starostlivosti: systematický prehľad. INT J NURS STUD [článok v časopise; prehľad]. 2023 01.01.2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Rakovina pankreasu. Lancet. [Článok v časopise; podpora výskumu, NIH, extramurálne; podpora výskumu, vláda mimo USA; prehľad]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemiológia rakoviny pankreasu. World Journal of Gastroenterology. [Článok v časopise, prehľad]. 2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nový nomogram súvisiaci s tp53 na predpovedanie celkového prežitia u pacientov s rakovinou pankreasu. BMC Cancer [článok v časopise]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Vplyv terapie zameranej na roztok na únavu súvisiacu s rakovinou u pacientov s kolorektálnym karcinómom, ktorí dostávajú chemoterapiu: randomizovaná kontrolovaná štúdia. Onkologická sestra. [Článok v časopise; randomizovaná kontrolovaná štúdia; štúdiu podporuje vláda mimo Spojených štátov]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y a kol. Pooperačné hladiny karcinoembryonálneho antigénu (CEA) predpovedajú výsledok po resekcii kolorektálneho karcinómu u pacientov s normálnymi predoperačnými hladinami CEA. Centrum pre translačný výskum rakoviny. [Článok v časopise]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X a kol. Imunitne súvisiace lncRNA generujú nové signatúry a predpovedajú imunitnú krajinu ľudského hepatocelulárneho karcinómu. Mol Ther Nucleic acids [Článok v časopise]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Imunoterapia rakoviny pankreasu: bariéry a objavy. Ann Gastrointestinal Surgeon [Článok v časopise; prehľad]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Dlhé nekódujúce RNA (LncRNA), genomika vírusových nádorov a aberantné zostrihové udalosti: terapeutické dôsledky. AM J CANCER RES [článok v časopise; prehľad]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Identifikácia podpisov lncRNA spojených s prognózou rakoviny endometria. Achievements of science [článok v časopise]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S a kol. Komplexná analýza prognostických génov pre RNA-viažuce proteíny a kandidátov na liečivá pri papilárnobunkovom karcinóme obličkových buniek. pregen. [Článok v časopise]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X a kol. Charakteristiky dlhej nekódujúcej RNA súvisiacej s autofágiou predpovedajú prognózu rakoviny prsníka. pregen. [Článok v časopise]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. S imunitným systémom súvisiaci podpis šiestich dlhých lncRNA zlepšuje prognózu pri multiformnom glioblastóme. MOL Neurobiology. [Článok v časopise]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z a kol. Nový podpis tri-lncRNA predpovedá prežitie pacientov s rakovinou pankreasu. ZÁSTUPCOVIA ONKOL. [Článok v časopise]. 2018 12.01.2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 podporuje progresiu rakoviny pankreasu reguláciou expresie LIN28B a dráhy PI3K/AKT prostredníctvom hubovitej miR-577. Mol Therapeutics – Nukleové kyseliny. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L a kol. Pozitívna spätná väzba medzi lncRNA FLVCR1-AS1 a KLF10 môže inhibovať progresiu rakoviny pankreasu prostredníctvom dráhy PTEN/AKT. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Identifikácia trinástich génov predikujúcich celkové prežitie pri hepatocelulárnom karcinóme. Biosci Rep [článok v časopise]. 2021 04.09.2021.
Čas uverejnenia: 22. septembra 2023